A lo largo de la historia la Secretaria de Educación en el Estado (SEE) ha padecido de una serie de irregularidades graves que mantienen en los últimos lugares a la entidad en este rubro, a decir del dirigente del Comité Ejecutivo Delegacional D - III - 6 del Sindicato de Trabajadores de la Educación (SNTE) Sección 18, Juan Manuel Macedo Negrete se destacan la duplicidad de por lo menos 800 plazas duplicadas actualmente.

Durante una rueda de prensa brindada en las instalaciones de la dependencia estatal señaló que un factor que afecta de manera directa en el presupuesto educativo es la cantidad de oficinas alternas por la que se paga rentas en las que mensualmente se destinan por lo menos un millón de pesos.

Dinero que señaló vendría a mejorar el rezago en infraestructura educativa que se tiene en la entidad.

Asimismo precisó que existe un exceso de personal de confianza de por lo menos 100 personas en puestos que podrían utilizar los propios trabajadores administrativos de la dependencia, esto según cifras del 2011.